I sistemi di acqua pura sono principalmente suddivisi in sistemi di osmosi inversa, sistemi di scambio ionico, sistemi di elettrodeionizzazione (EDI) e sistemi di ultrafiltrazione. Diversi sistemi sono adatti per applicazioni di laboratorio, industriali o domestiche a seconda del processo e della qualità degli effluenti.
I tipi comuni basati sulla tecnologia di applicazione e purificazione sono i seguenti:
Sistema a osmosi inversa (RO): rimuove oltre il 95% di ioni, materia organica, batteri e particolato attraverso la filtrazione su membrana semi-permeabile, producendo acqua pura di Grado III (acqua RO). Ampiamente utilizzato per la pulizia di base del laboratorio, il risciacquo della vetreria e come fase di pretrattamento dell'acqua ad alta-purezza.
Sistema di scambio ionico: utilizza ioni funzionali sulla resina per lo scambio con ioni come calcio, magnesio e sodio nell'acqua, rimuovendo efficacemente gli ioni di durezza e i sali disciolti. Spesso utilizzato nella fase di trattamento fine per migliorare la purezza dell'acqua.
Sistema di elettrodeionizzazione (EDI): combina le tecnologie di elettrodialisi e scambio ionico, rimuovendo continuamente gli ioni dall'acqua sotto un campo elettrico a corrente continua. Non è necessaria alcuna rigenerazione chimica. Può produrre stabilmente acqua pura di Grado II o anche acqua ultrapura di Grado I, adatta per settori di alto-standard come quello elettronico e farmaceutico.
I sistemi di ultrafiltrazione utilizzano membrane di ultrafiltrazione per rimuovere grandi molecole organiche, pirogeni e microrganismi trattenendo alcuni minerali. Sono comunemente utilizzati negli esperimenti di scienze della vita per applicazioni sensibili a RNasi/DNasi.

